Protein–RNA interactions for Protein: P05106

ITGB3, Integrin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3P05106 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ITGB3P05106 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms