Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4FO95754 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms