Protein–RNA interactions for Protein: O75533

SF3B1, Splicing factor 3B subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B1O75533 B4GALT3-209ENST00000486938 308 ntTSL 27.88□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PTK2-221ENST00000520460 572 ntTSL 47.88□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC019080.1-205ENST00000625449 780 ntTSL 57.87□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CALB1-204ENST00000476853 534 ntTSL 27.86□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC093766.1-201ENST00000502606 866 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FYN-226ENST00000523570 597 ntTSL 57.85□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NPLOC4-221ENST00000625705 405 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLMAP-204ENST00000416658 1570 ntTSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EZH1-220ENST00000591330 2387 ntTSL 1 (best)7.84□□□□□ -1.158e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IPO11-214ENST00000514647 584 ntTSL 27.81□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHURC1-204ENST00000551093 1023 ntTSL 27.8□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FGF13-203ENST00000421460 352 ntTSL 1 (best)7.79□□□□□ -1.163e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NR3C1-205ENST00000415690 3789 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF33A-204ENST00000458705 6084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL009031.1-201ENST00000632346 1026 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAN1A2-205ENST00000482811 724 ntTSL 47.78□□□□□ -1.168e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 KPNA1-201ENST00000344337 6830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FGD6-206ENST00000550368 479 ntTSL 37.77□□□□□ -1.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NLRC4-204ENST00000404025 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.178e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SCAPER-218ENST00000567618 565 ntTSL 37.7□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CALB1-211ENST00000523716 636 ntTSL 27.7□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIA3-205ENST00000450260 605 ntTSL 27.69□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TTLL7-208ENST00000477524 8452 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TIA1-218ENST00000496096 511 ntTSL 37.68□□□□□ -1.188e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CPQ-205ENST00000521142 677 ntTSL 47.64□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VPS53-204ENST00000437048 13106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 107
SF3B1O75533 METTL8-217ENST00000612742 8132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-212ENST00000507984 623 ntTSL 37.62□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DLG2-203ENST00000376104 5139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPIN1-204ENST00000483785 659 ntTSL 57.59□□□□□ -1.198e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C15orf41-210ENST00000566807 564 ntTSL 47.58□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 EDA-206ENST00000503592 557 ntTSL 57.55□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 OFCC1-209ENST00000472329 1034 ntTSL 27.53□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AL365259.1-201ENST00000606334 509 ntTSL 5 BASIC7.53□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 COG4-208ENST00000534772 647 ntTSL 37.53□□□□□ -1.28e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 DIEXF-201ENST00000457820 2895 ntTSL 27.51□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SCMH1-216ENST00000489421 687 ntTSL 37.5□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC008736.1-201ENST00000592431 568 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-210ENST00000506554 3469 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-205ENST00000502983 609 ntTSL 37.48□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-204ENST00000502831 851 ntTSL 57.48□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNPC3-209ENST00000533834 3658 ntTSL 1 (best)7.46□□□□□ -1.218e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LINC02275-201ENST00000508313 4365 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NLRP2-216ENST00000585500 576 ntTSL 57.45□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 HM13-225ENST00000619859 455 ntTSL 37.45□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SMG1-210ENST00000565224 2372 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NARS2-204ENST00000528850 2137 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C1D-202ENST00000407324 1379 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 FHIT-203ENST00000466788 3063 ntTSL 47.43□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SNX13-212ENST00000498463 687 ntTSL 37.42□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LCLAT1-210ENST00000488144 536 ntTSL 37.42□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC097103.2-205ENST00000515247 567 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZRANB2-AS2-215ENST00000596952 624 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ABI1-206ENST00000376140 1446 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-204ENST00000394865 1222 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.228e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MIR181A2HG-201ENST00000429139 662 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 AC008764.4-202ENST00000601636 437 ntTSL 37.36□□□□□ -1.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 NEDD4L-207ENST00000435432 3417 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.238e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CPQ-203ENST00000519484 553 ntTSL 47.32□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CD33-203ENST00000421133 1023 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 TRAF3IP2-AS1-204ENST00000440395 439 ntTSL 37.32□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 BBS7-203ENST00000505692 752 ntTSL 27.3□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GTF2A1-202ENST00000434192 1199 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RBM6-212ENST00000446471 695 ntTSL 47.3□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CPQ-204ENST00000519900 566 ntTSL 47.29□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC36A1-210ENST00000522185 751 ntTSL 37.27□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CCDC144NL-AS1-203ENST00000433763 647 ntTSL 37.27□□□□□ -1.248e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SLC2A14-201ENST00000340749 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MAGT1-204ENST00000610432 4019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-208ENST00000495161 1321 ntTSL 27.26□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-201ENST00000340208 6192 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 ZNF14-201ENST00000344099 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 LRMP-207ENST00000550945 1426 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 CFAP70-205ENST00000433268 1710 ntTSL 27.22□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.258e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 RNF213-210ENST00000560083 4212 ntTSL 27.21□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 SPATS2L-217ENST00000449647 678 ntTSL 57.21□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 GTF2IP6-201ENST00000583143 541 ntBASIC7.2□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 C2CD5-212ENST00000542676 3438 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MEF2C-214ENST00000508610 557 ntTSL 47.19□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 PIK3IP1-AS1-201ENST00000440456 554 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
SF3B1O75533 MYO9A-210ENST00000564699 693 ntTSL 47.18□□□□□ -1.268e-6■■■■■ 107
Retrieved 100 of 46,956 protein–RNA pairs in 1485.3 ms