Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
TIMM17BO60830 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
TIMM17BO60830 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms