Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
BCKDKO14874 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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