Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
E9PCH4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
E9PCH4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
E9PCH4 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
E9PCH4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
E9PCH4 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
E9PCH4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms