Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C4orf47A7E2U8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C4orf47A7E2U8 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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