Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ARID3CA6NKF2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms