Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TTF2Q9UNY4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms