Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK2

ATXN7L1, Ataxin-7-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN7L1Q9ULK2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATXN7L1Q9ULK2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ATXN7L1Q9ULK2 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms