Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms