Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL3

CASP8AP2, CASP8-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,982 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CASP8AP2Q9UKL3 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms