Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MBD1Q9UIS9 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MBD1Q9UIS9 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms