Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
POLKQ9UBT6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
POLKQ9UBT6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms