Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SCHIP1Q9P0W5 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms