Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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MIS18AQ9NYP9 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
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MIS18AQ9NYP9 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MIS18AQ9NYP9 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
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MIS18AQ9NYP9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
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MIS18AQ9NYP9 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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MIS18AQ9NYP9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MIS18AQ9NYP9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
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