Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
ATG3Q9NT62 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ATG3Q9NT62 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms