Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
RAB6BQ9NRW1 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms