Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPR2

SEMA4B, Semaphorin-4B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4BQ9NPR2 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SEMA4BQ9NPR2 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms