Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms