Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
APOBEC3GQ9HC16 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms