Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BHLHE41Q9C0J9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BHLHE41Q9C0J9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms