Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LRRC3Q9BY71 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms