Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
KDM5DQ9BY66 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KDM5DQ9BY66 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms