Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
KATNB1Q9BVA0 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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