Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3R4Q99570 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3R4Q99570 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3R4Q99570 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIK3R4Q99570 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms