Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP88Q99567 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms