Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YTHDC1Q96MU7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YTHDC1Q96MU7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms