Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC97Q96F63 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms