Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TM4SF18Q96CE8 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TM4SF18Q96CE8 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms