Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRSF12Q8WXF0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms