Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ATG16L2Q8NAA4 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms