Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIP4Q8N3C7 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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