Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SPOCD1Q6ZMY3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms