Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TSSK4Q6SA08 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms