Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
MED27Q6P2C8 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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