Protein–RNA interactions for Protein: Q68CZ2

TNS3, Tensin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3Q68CZ2 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TNS3Q68CZ2 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TNS3Q68CZ2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms