Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
OTUD3Q5T2D3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
OTUD3Q5T2D3 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms