Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PERM1Q5SV97 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 3274.8 ms