Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV4

BRMS1L, Breast cancer metastasis-suppressor 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1LQ5PSV4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
BRMS1LQ5PSV4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms