Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RFTN2Q52LD8 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RFTN2Q52LD8 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms