Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y2

PKDCC, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCCQ504Y2 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PKDCCQ504Y2 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms