Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
KLHL38Q2WGJ6 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
KLHL38Q2WGJ6 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms