Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
COL24A1Q17RW2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
COL24A1Q17RW2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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