Protein–RNA interactions for Protein: Q17RD7

SYT16, Synaptotagmin-16, humanhuman

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT16Q17RD7 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SYT16Q17RD7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms