Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PDK4Q16654 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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