Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms