Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC6Q16204 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC6Q16204 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms