Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TAF1AQ15573 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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