Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SYCP1Q15431 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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SYCP1Q15431 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYCP1Q15431 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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